สำนักงานอธิการบดี มหาวิทยาลัยพายัพ ตั้งขึ้นในปี พ.ศ. 2521 เป็นหน่วยงานที่มีสายการบังคับบัญชาขึ้นตรงต่ออธิการบดี และมีบทบาทสำคัญในการเป็นหน่วยงานหลักที่ทำหน้าที่ประสานงานการบริหารจัดการของมหาวิทยาลัย การให้บริการและการสนับสนุนการเรียนการสอน เพื่อให้การดำเนินงานของมหาวิทยาลัยเป็นไปด้วยความคล่องตัวและมีประสิทธิภาพ